Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms