Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms