Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms