Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMNQ96JQ2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms