Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms