Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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