Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPDL1Q96EA4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPDL1Q96EA4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPDL1Q96EA4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms