Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3AQ92484 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms