Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms