Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms