Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms