Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms