Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSAMQ8N6F7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms