Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms