Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS8Q8N3P4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS8Q8N3P4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms