Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D4Q7Z3S7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms