Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms