Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL6Q6ICC9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL6Q6ICC9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms