Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG9BQ674R7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms