Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSBN1Q5VWQ0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms