Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms