Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDSS1Q5T2R2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms