Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms