Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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