Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFE2Q16621 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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