Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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