Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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NTRK3Q16288 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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