Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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E2F4Q16254 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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E2F4Q16254 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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