Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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