Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms