Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SPIDRQ14159 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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