Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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