Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms