Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms