Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms