Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms