Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms