Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms