Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms