Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms