Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms