Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms