Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPC1P35052 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPC1P35052 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms