Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRS3P32247 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms