Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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