Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA5P30532 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms