Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms