Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms