Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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