Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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